Родился в кишлаке Кокташ Локай-Таджикского района (расположен к юго-западу от Душанбе) в семье бухарского чиновника узбекского происхождения.

Занимал должность сборщика налога. В 1920 г. получил титул бека и поступил на службу к эмиру Бухарского эмирата Сейиду Алим-хану. После провозглашения Бухарской Народной Советской Республики (октябрь 1920) прибыл в Душанбе, где начал формировать новое правительство и армию. В сентябре 1920 г. эмир бежал в Восточную Бухару, а в 1921 г. в Афганистан. Ибрагим-бек возглавил вооруженную борьбу басмачей за восстановление власти эмира на территории Восточной Бухары. Под началом Ибрагим-бека находилось до 4 тысяч человек. Восстановив прежние порядки в Центральном и Южном Таджикистане, осенью 1921 г. предпринял несколько попыток осады Душанбе.

В 1922 г. курбаши (полевой командир) вооруженных групп локайцев в борьбе против войск Энвер-паши (турецкий военный и политический деятель, один из лидеров младотурок, который в 1921 г. принял участие в антисоветском басмаческом движении). После гибели 4 августа 1922 г. Энвер-паши Ибрагим-бек стал главным предводителем басмачей – выходцев из бывшего Бухарского эмирата.

Осенью 1922 г. Рабоче-крестьянская Красная Армия (РККА)  продолжала вести бои в Восточной Бухаре, против нового ставленника Алим-хана, турецкого офицера и английского агента Селим-паши (настоящее имя Ходжа Салим-бей). В конце мая 1923 г. между Селим-пашой и Ибрагим-беком разгорелась борьба за лидерство в басмаческом движении, которое привело к поражению Ибрагим-бека. В 1924–1925 гг. провел реорганизацию своих отрядов и возглавил поход на территорию Восточной Бухары. В июне 1926 г. отряд Ибрагим-бека был разбит, а сам он скрылся на территории Афганистана.

После этого войско Ибрагим-бека (2-3 тысячи басмачей) неоднократно переходило границу, грабило советские кишлаки, убивало активистов.

В 1928 г. вступил в конфликт с властями Афганистана. В 1929 г. воевал против частей РККА на территории Афганистана. Пытался объединить под своим командованием все басмаческие силы Ирана и Афганистана и, по данным советской разведки, создать самостоятельное узбекско-таджикское государство во главе с Алим-ханом. Неоднократно предпринимал попытки вторжения на территорию СССР.

23 июня 1931 г. взят в плен специальным отрядом Особого государственного политического управления (ОГПУ). 31 августа 1931 г. приговорен к высшей мере наказания и расстрелян в Ташкенте.