Во время антигетманского восстания в ноябре–декабре 1918 г. боротьбисты не присоединились к сторонникам Директории (высший орган власти Украинской Народной Республики (УНР) с 14 декабря 1918 по 10 ноября 1920 г.), а выступили за создание Украинской Социалистической Федеративной Республики Советов в союзе с другими социалистическими республиками, в том числе РСФСР. В январе–феврале 1919 г. они вошли в состав Временного рабоче-крестьянского правительства (с конца января – Совет народных комиссаров) Украинской Социалистической Советской Республики (УССР). Совместно с Коммунистической партии (большевиков) Украины – КП(б)У – боротьбисты участвовали в организации вооруженных выступлений против Директории УНР, которые были подавлены. В марте 1919 г. на III Всеукраинском съезде Советов проголосовали за резолюции большевиков, а Всеукраинский Центральный исполнительный комитет (ВУЦИК) был сформирован на двухпартийной основе: 90 представителей от КП(б)У и 10 от боротьбистов.
На I (V) партийном съезде в Харькове 3–11 марта 1919 г. УПСР(боротьбистов) была переименована в УПСР(коммунистов-боротьбистов) – УПСР(к.-б.). При этом на практике часто использовалось наименование УПСР(коммунистов) – УПСР(к). В учредительных документах партия признала социалистический характер Октябрьской революции и диктатуру пролетариата и одновременно выдвинула идею украинского коммунизма, делая акцент на национальном аспекте преобразований, что вызывало противоречия с большевиками.
Летом 1919 г. войска Рабоче-крестьянской Красной армии (РККА) на территории Украины потерпели поражение от войск А. И. Деникина. Причиной этого лидеры боротьбистов считали оторванность коммунистов от местных сил и условий. 6 августа 1919 г. ЦК УПСР(к.-б.) подписал акт с ЦК УСДРП(независимых) (отколовшегося в 1919 г. крыла УСДРП) о слиянии партий и образовании единой Украинской коммунистической партии (боротьбистов) – УКП(б). Таким образом они противопоставили себя КП(б)У, которую считали временной «областной организацией» РКП(б). В конце августа и ноябре 1919 г. ЦК УКП(б) дважды безуспешно пытался вступить в ряды Коминтерна от Украины.
Осенью 1919 г. во время контрнаступления РККА боротьбисты вновь перешли к совместным действиям с большевиками. В декабре 1919 – феврале 1920 г. боротьбисты входили в состав Всеукраинского революционного комитета – временного высшего органа советской власти Украины, а также в руководство наркоматов просвещения, юстиции, финансов.
В начале 1920 г. на фоне побед над белыми противоречия между КП(б)У и боротьбистами обострились. КП(б)У начала привлекать в свои ряды членов УКП(боротьбистов), одновременно запустив кампанию по дискредитации партии (обвинения в поддержке «петлюровцев» и «повстанческих контрреволюционных элементов»). С середины февраля 1920 г. ряд местных организаций боротьбистов объявил о самороспуске и желании вступить в КП(б)У. Участились случаи индивидуальных выходов из партии. ЦК КП(б)У заявил о разрыве соглашения с боротьбистами и персональном приеме желающих вступить в КП(б)У, а Исполком Коминтерна во главе с Г. Е. Зиновьевым единогласно отказал УКП(боротьбистов) в приеме, обвинив партию в отступлении от принципов коммунизма.
20 марта 1920 г. Всеукраинская конференция УКП(боротьбистов) заявила о самоликвидации партии и вступлении ее членов в ряды КП(б)У. По разным оценкам, в КП(б)У было принято от 5 до 15 тысяч боротьбистов. Оставшиеся члены примкнули к Украинской коммунистической партии (образовалась из правого крыла УСДРП (независимых), действовала в январе 1920 – марте 1925), либо ушли в подполье. Летом–осенью 1920 г. при перерегистрации партбилетов многих бывших боротьбистов исключили за «националистические пережитки». Однако некоторые из бывших членов партии (Г. Ф. Гринько, А. Я. Шумский, П. П. Любченко и др.) оказались в руководстве КП(б)У.