Партия не признала Октябрьский переворот и власть Советов. Своей основной целью «Алаш-Орда» считала подавление и ликвидацию большевиков. 10 ноября 1917 г. лидеры «Алаш» направили «Декларацию» казачьим войскам, начавшим вооруженную борьбу с советской властью. В документе заявлялось о присоединении «Алаш-Орды» к Юго-восточному союзу казачьих войск, горцев Кавказа и вольных народов, председателем которого был А. М. Каледин. «Алаш-Орда» находилась в военно-политическом союзе с Временным Сибирским правительством, Комитетом членов Учредительного собрания (Комуч), Башкирской автономией. В конце ноября 1917 г. М. Т. Тынышпаев и М. Шокай (Чокаев) участвовали в организации Туркестанской (Кокандской) автономии, ставшей средоточием сил по борьбе с большевиками в Средней Азии.

 

Официального подтверждения статуса автономии от Уфимского государственного совещания и  А. В. Колчака «Алаш-Орда» не получила. В партии образовалась группа, выступавшая за нейтральное отношение к большевикам, которые обещали создание казахской автономии на платформе советской власти. Данный компромисс не был осуществлен из-за поражения красных летом 1918 г. на севере, востоке и в ряде западных районов казахских земель. В 1918–1919 гг. отряды алашевцев вели активную вооруженную борьбу со сторонниками советской власти в Казахстане, входили в войска белых – А. И. Дутова, А. В. Колчака, Б. В. Анненкова и др.

 

В октябре–ноябре 1919 г., после наступления Рабоче-крестьянской Красной армии (РККА) на казахских территориях, лидеры «Алаш» пошли на переговоры с большевиками. В декабре 1919 г. представители партии подписали соглашение с делегацией Реввоенсовета 1-й армии РККА, предусматривавшего полную капитуляцию алашевцев, что давало им право на амнистию. Капитуляция ознаменовала собой конец партии «Алаш» как политического целого, хотя часть ее активистов пыталась продолжать борьбу. 9 марта 1920 г. решением Киргизского (Казахстанского) революционного комитета распущены центральное правительство алашевцев в Семипалатинске и его филиалы в Омске, Акмолинске, Тургае, Петропавловске.